دانشگاه ملایر از امکانات آموزشی، آزمایشگاهی و کارگاهی مناسبی نسبت به دانشگاه های همتراز خود برخوردار است، بطوریکه این دانشگاه دارای بیش از 90 کلاس آموزشی تجهیز شده، 23 آزمایشگاه، 7 کارگاه و 10 سایت کامپیوتری شامل بیش از 275 دستگاه کامپیوتر است که جهت استفاده تحقیقاتی در دسترس اعضای هیات علمی، دانشجویان دکتری، کارشناسی ارشد و کارشناسی است و قابلیت سرویس دهی به محققان و دانشجویان سایر مراکز را نیز دارد.
از این مجموعه می توان به آزمایشگاه مرکزی شهید فرهاد توسکی که درسال 89 افتتاح شده است و بخش مهمی از فعالیت های آزمایشگاهی را پوشش می دهد اشاره نمود. این آزمایشگاه هم اکنون دارای دستگاههای پیشرفته فعالی از جمله اتمیک ابزوربشن، اتمیک تک لامپی، دستگاه xrd , hplc ، سانتریفیوژ یخچالدار 1800 دور، دستگاه GC , سوکسله، دستگاه سنجش ضرایب فیزیکی محصولات کشاورزی ،دیپ فریزر 70 درجه، ژرمیناتور 600 لیتری و امکانات پیشرفته زیادی جهت انجام امور تحقیقاتی است.